Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo48Q8CAT8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo48Q8CAT8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms