Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp20Q8C6M1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Usp20Q8C6M1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Usp20Q8C6M1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp20Q8C6M1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms