Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe22Q8C6A8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms