Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc22Q8C5N3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms