Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot2Q8C5L3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot2Q8C5L3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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