Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sfrp1Q8C4U3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfrp1Q8C4U3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms