Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l1Q8C0J2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms