Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccser1Q8C0C4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccser1Q8C0C4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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