Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp38Q8BW70 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Usp38Q8BW70 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Usp38Q8BW70 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Usp38Q8BW70 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Usp38Q8BW70 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Usp38Q8BW70 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp38Q8BW70 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp38Q8BW70 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp38Q8BW70 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp38Q8BW70 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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