Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssc5dQ8BV57 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssc5dQ8BV57 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssc5dQ8BV57 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms