Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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