Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup54Q8BTS4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup54Q8BTS4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms