Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pbrm1Q8BSQ9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms