Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms