Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms