Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnrc6bQ8BKI2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnrc6bQ8BKI2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnrc6bQ8BKI2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms