Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdca8Q8BHX3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdca8Q8BHX3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms