Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Susd4Q8BH32 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Susd4Q8BH32 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms