Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sv2bQ8BG39 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms