Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms