Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg4cQ811C2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Atg4cQ811C2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Atg4cQ811C2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Atg4cQ811C2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Atg4cQ811C2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Atg4cQ811C2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Atg4cQ811C2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Atg4cQ811C2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Atg4cQ811C2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Atg4cQ811C2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg4cQ811C2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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