Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp8Q80YR6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms