Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ttc28Q80XJ3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ttc28Q80XJ3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ttc28Q80XJ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ttc28Q80XJ3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ttc28Q80XJ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ttc28Q80XJ3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ttc28Q80XJ3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttc28Q80XJ3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttc28Q80XJ3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc28Q80XJ3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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