Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab3gap1Q80UJ7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms