Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll4Q80UG8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll4Q80UG8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms