Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ube3cQ80U95 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Ube3cQ80U95 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Ube3cQ80U95 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Ube3cQ80U95 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ube3cQ80U95 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Ube3cQ80U95 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Ube3cQ80U95 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ube3cQ80U95 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3cQ80U95 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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