Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170bQ80U49 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170bQ80U49 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep170bQ80U49 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170bQ80U49 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms