Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgef17Q80U35 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms