Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf7ipQ7TT18 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms