Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sgo2Q7TSY8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms