Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lamp3Q7TST5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms