Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf18Q7TS55 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms