Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc93Q7TQK5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc93Q7TQK5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms