Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snd1Q78PY7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snd1Q78PY7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms