Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eci3Q78JN3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms