Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme8Q715T0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nme8Q715T0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms