Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27Q6ZWU9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27Q6ZWU9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms