Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Syne1Q6ZWR6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Syne1Q6ZWR6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Syne1Q6ZWR6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Syne1Q6ZWR6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Syne1Q6ZWR6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Syne1Q6ZWR6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Syne1Q6ZWR6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Syne1Q6ZWR6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Syne1Q6ZWR6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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