Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Topbp1Q6ZQF0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Topbp1Q6ZQF0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms