Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nemp1Q6ZQE4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms