Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Efr3bQ6ZQ18 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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Efr3bQ6ZQ18 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Efr3bQ6ZQ18 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Efr3bQ6ZQ18 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Efr3bQ6ZQ18 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Efr3bQ6ZQ18 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Efr3bQ6ZQ18 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Efr3bQ6ZQ18 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Efr3bQ6ZQ18 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efr3bQ6ZQ18 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efr3bQ6ZQ18 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Efr3bQ6ZQ18 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efr3bQ6ZQ18 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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