Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M2Q6W9L1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M2Q6W9L1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms