Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms