Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hsh2dQ6VYH9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hsh2dQ6VYH9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms