Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Ift172Q6VH22 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ift172Q6VH22 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms