Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Timd4Q6U7R4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Timd4Q6U7R4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms