Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd300ld3Q6SJQ5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300ld3Q6SJQ5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms