Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dtx4Q6PDK8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dtx4Q6PDK8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms