Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb39Q6PDK0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb39Q6PDK0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms