Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rundc3bQ6PDC0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc3bQ6PDC0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms